Readme pour les scripts "script.tar.gz"
L'archive "script.tar.gz" du 02.02.2022 contient les scripts pour le
post-traitement des simuls 3D sur le depot HighTune ici:
HighTune/explorer/models/LMDZ

tocsv.sh / merge_csv.sh :
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crée un fichier de métriques 3D du type :
SIM,glob.rt,glob.rlut,circAa.rsut,circAa.rlut,subs.rsut,weak...
SCM_3-001,1.869,239.434,31.0417,-55.685,94.3896,80.3383,80.9...
SCM_3-002,2.841,238.867,26.2022,-50.383,81.107,82.4628,97.25...
SCM_3-003,2.3084,241.722,29.271,-49.713,93.4692,77.8103,74.9...
Si certaines simulations ce sont plantées, on fait en sorte qu'elle
n'apparaissent pas dans ce fichier.

tocsv.sh utilise les métriques créées sur les multi-atltas sur
ciclad, et on extrait avec ce script des métriques déjà calculées.
On s'était dit avec Ionela que c'était sans doute aussi simple de faire un
script qui calcule les métriques csv, et seulement celles dont on a
besoin. Je pense que Maelle est parti là dessus également.

Ca peut être intéressant de garder aussi la version multiatlas permettait
d'avoir plein de métriques déjà calculées à disposition et de jouer avec.
Mais c'est un peu coûteux parce qu'on précalcule beaucoup plus de
métriques que ce dont on a besoin.

merge_csv_othermet.sh :
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merge des fichiers de metriques individuelles (pour simulations et references) 
en un seul fichier (metrics_${nwave}.sh et obs.csv), pour toutes les métriques
que vous voulez (sauf les métriques 1D gérées automatiquement bien sur)
A faire avant combine_csv.sh

combine_csv.sh :
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(c'est le script principal dont je parlais ce matin)
Va combiner ce fichier de métriques 3D avec les métriques 1D déjà
calculées. Un élément important est de recréer des fichiers de paramètres
et de métriques (aussi bien en csv qu'en .Rdata) avec seulement les
simulations qui n'ont pas planté en 3D.

Le script va directement travailler sur le répertoire HighTune/WORK
avec un chemin d'accès contrôlé par
wave=47
ITUNE_D=/home/hourdin/ITUNE/R270/HighTune/WORK/LUDO2
au début du script.

La sélection des simulations OK se fait grâce à la boucle
for sim in `awk ' { print $1 } ' WRKLR/metrics.csv | cut -d, -f1` ; do
(on part du principe que le metrics.csv 3D est sur WRKLR ; ce sera bien
aussi de paramétrer ça).
On extrait les métriques 1D dans
$ITUNE_D/metrics_WAVE${wave}_${wave}_1D.csv
et les paramètres dans
grep $sim $ITUNE_D/WAVE${wave}_1D/Par1D_Wave${wave}.asc

On transforme tout ça en .Rdata avec
Rscript --vanilla htune_reduce_param.R $wave
Rscript --vanilla htune_csv2Rdata.R $wave


get.sh :
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Pour aller chercher les métriques scalaires sur ciclad si on passe
par le multiatlas.


post_scores.sh :
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Tri et tracé de simulations suivant les métriques.
Il y a l'équivalent en 1D aussi.

Il y a d'autres scripts de tracer (pp.sh, post.sh) mais qui datent sans
doute de versions précédentes.
Il faudra sans doute aussi que j'exume les scripts 3D des moyennes
zonales.
Mais ca c'est bien archivé, au moin dans le doi des codes en
accompagnement du papier.

Frédéric